Er zijn twee bronnen voor de wit-blauw-rode kleuren van de Sloveense nationale vlag. Voor zijn nationale etnische vlag had Slovenië ten tijde van de Napoleontische oorlogen een kopie van de Russische vlag aangenomen om solidariteit te tonen met andere Slavische volkeren. Maar al eerder had de keizer van het Heilige Roomse Rijk een wapenschild verleend aan het "Kroonland van Carniola", dat toen deel uitmaakte van het rijk. Dit wapen had een wit schild met daarop een blauwe adelaar met een rood-wit geruite halve maan op zijn borst. Een ander belangrijk wapen in de Sloveense geschiedenis was dat van het graafschap Celje - een blauw schild met drie gele sterren. Eindelijk, onder het communistische regime van de 20e eeuw, had het wapen van Slovenië blauwe en witte golvende horizontale lijnen die de Adriatische kust van het land suggereerden, evenals een gestileerde berg met drie punten - de hoogste van Slovenië, de beroemde Triglav.
Slovenië riep op 25 juni 1991 zijn onafhankelijkheid uit, maar moest vechten tegen het Joegoslavische leger om zijn soevereiniteit te vestigen. De vlag die op Independence Day werd gehesen, was de traditionele wit-blauw-rode pan-Slavische driekleur. Om het te onderscheiden van de gelijkaardige vlaggen van Rusland en Slowakije, werd het nieuwe wapen van Slovenië toegevoegd in de bovenste hijshoek die de witte en blauwe strepen overlapt. Dat schild heeft een combinatie van de Triglav en golvende strepen van de communistische armen met de gele sterren op een blauwe achtergrond van het Celje-schild.
