Afwisseling van generaties, ook wel metagenese of heterogenese genoemd, in de biologie, de afwisseling van een seksuele fase en een aseksuele fase in de levenscyclus van een organisme. De twee fasen of generaties zijn vaak morfologisch en soms chromosomaal verschillend.
Bij algen, schimmels en planten is afwisseling van generaties gebruikelijk. Het is echter niet altijd gemakkelijk te observeren, omdat de ene of de andere generatie vaak erg klein is, zelfs microscopisch. De seksuele fase, de gametofytgeneratie genoemd, produceert gameten of geslachtscellen, en de aseksuele fase, of de sporofytgeneratie, produceert aseksueel sporen. In termen van chromosomen is de gametofyt haploïde (heeft een enkele set chromosomen) en de sporofyt is diploïde (heeft een dubbele set). Bij bryofyten, zoals mossen en levermossen, is de gametofyt de dominante levensfase, terwijl bij angiospermen en gymnospermen de sporofyt dominant is. De haploïde fase is ook dominant bij schimmels. Hoewel sommige algen bepaalde levenscyclusfasen hebben, wisselen veel soorten af tussen de seksuele en aseksuele fasen als reactie op omgevingsomstandigheden.
Onder dieren hebben veel ongewervelde dieren een afwisseling van seksuele en aseksuele generaties (bijv. Protozoa, kwallen, platwormen), maar de afwisseling van haploïde en diploïde generaties is onbekend.
