Yahya Khan, voluit Agha Mohammad Yahya Khan, (geboren op 4 februari 1917, nabij Peshawar, India [nu in Pakistan] - overleden op 10 augustus 1980, Rawalpindi, Pakistan), president van Pakistan (1969–71), beroepsmilitair die in 1966 opperbevelhebber van de Pakistaanse strijdkrachten werd.
Yahya werd geboren in een familie die afstamde van de elite-soldatenklasse van Nāder Shah, de Perzische heerser die Delhi in de 18e eeuw veroverde. Hij volgde een opleiding aan de Punjab University en studeerde later eerst in zijn klas af aan de Indian Military Academy in Dehra Dun. Hij diende tijdens de Tweede Wereldoorlog in Italië en het Midden-Oosten en organiseerde na de opdeling van India in 1947 het Pakistaanse Staff College.
Na in de oorlog met India in de regio Kasjmir te hebben gediend, werd hij op 34-jarige leeftijd de jongste brigadegeneraal van Pakistan en de jongste generaal op 40-jarige leeftijd. Hij werd in 1966 opperbevelhebber. Een protegé van Pres. Mohammad Ayub Khan, Yahya voerde het bevel over het leger toen er in het land straatopstanden uitbraken. Ayub riep hem op de leiding van de regering over te nemen en de integriteit van Pakistan te behouden. Hij werd aangesteld als hoofdadministrateur van de staat van beleg, die hij verklaarde met de woorden: “Ik tolereer geen wanorde. Laat iedereen terugkeren naar zijn post. '
Yahya Khan volgde Ayub Khan op als president toen deze in maart 1969 zijn functie neerlegde. In 1971 brak er een ernstig conflict uit tussen de centrale regering en de Awami-partij in het toenmalige Oost-Pakistan, geleid door Sheikh Mujibur Rahman. De Oost-Pakistaanse leider eiste autonomie voor zijn helft van het geografisch verdeelde land, en Yahya Khan reageerde door het leger te bevelen de Awami-partij te onderdrukken. De wreedheid waarmee zijn bevelen werden uitgevoerd en de resulterende toestroom van miljoenen Oost-Pakistaanse vluchtelingen in India leidde tot de Indiase invasie van Oost-Pakistan en de vlucht van de West-Pakistaanse bezetters. Oost-Pakistan werd het onafhankelijke land van Bangladesh en met het verlies van Yahya Khan nam ontslag (20 december 1971).
Hij werd vervangen door zijn minister van Buitenlandse Zaken, Zulfikar Ali Bhutto, die hem onder huisarrest plaatste. Kort daarna werd hij verlamd door een beroerte en speelde hij na zijn vrijlating geen belangrijke politieke rol meer.
