Moldavië verklaarde zich onafhankelijk tijdens de Eerste Wereldoorlog. Op verschillende momenten in de voorgaande eeuwen maakte het deel uit van Moldavië, Rusland, het Ottomaanse Rijk en Roemenië, en de symbolen zijn afgeleid van historische en culturele banden met Moldavië en Roemenië. De vlag van december 1917 was de traditionele Roemeense driekleur van blauw, geel en rood in horizontaal formaat. In het midden stond het hoofd van een oeros, een uitgestorven Europese os. Deze vlag vloog slechts kort omdat Moldavië in april 1918 in Roemenië werd opgenomen. De Sovjet-Unie verwierf Moldavië in 1940 en na de Duitse en Roemeense bezetting tot 1944 werd de Moldavische Socialistische Sovjetrepubliek hersteld. Zijn kenmerkende vlag, aangenomen in 1952, voegde een groene horizontale streep toe door het midden van de Sovjet-rode vlag. Groen zou staan voor de wijnbouw en andere agrarische activiteiten van het gebied.
Tegen 1989 was de agitatie tegen het communistische bewind sterk in Moldavië en werd de blauw-geel-rode Roemeense driekleur een populair symbool. Het verving officieel de communistische vlag in mei 1990. Het nieuwe wapen van Moldavië, gebaseerd op traditionele ontwerpen, werd op 3 november van dat jaar toegevoegd: op de borst van een adelaar is een schild met een oeroskop omgeven door een halve maan, ster en bloem. Een traditioneel embleem van het Roemeense grondgebied van Walachia, de adelaar heeft een scepter en olijftak in zijn klauwen en een kruis in zijn snavel. De rode, blauwe en gouden kleuren van het schild weerspiegelen de nationale driekleur. De vlag bleef officieel na de onafhankelijkheid van Moldavië in 1991.
