Markos Eugenikos, (geboren c. 1392, Constantinopel - stierf 23 juni 1445, Constantinopel), Grieks-orthodoxe metropoliet van Efeze (nabij het moderne Selçuk, Tur.) En theoloog die de anti-unionistische partij in de Oosters-Orthodoxe Kerk leidde na de Raad van Florence, Italië (1439).
Na een klassieke en theologische opleiding onder leiding van docenten die antagonistisch waren voor Rome, gaf Eugenikos op 26-jarige leeftijd zijn eigendom aan de armen en werd monnik op het Griekse eiland Antigone. Gedwongen om terug te keren naar Constantinopel in 1422 vanwege islamitische intimidatie, verbleef hij in het stedelijke klooster van Mangani, waar hij een reputatie kreeg voor leren en heiligheid. Eugenikos, die door de Byzantijnse keizer John VIII Palaeologus (1425–48) voor het Concilie van Florence was verzorgd, werd metropoliet van Ephesus c. 1436 en vertegenwoordigde de patriarchen van Antiochië en Alexandrië op het concilie. In Florence gaf hij de meeste toegekende adressen aan de Grieks-orthodoxen en werd hij steeds krachtiger in zijn afwijzing van de westerse leer, met name over de Heilige Geest. Hij eiste dat de Latijnen de zin Filioque ("en van de Zoon") uit de geloofsbelijdenis van Nicea verwijderen en beschuldigden hen van het vervalsen van schriftuurlijke en patristische teksten om hun dogma te ondersteunen.
Eugenikos weigerde het definitieve herenigingsdocument van de raad te ondertekenen en keerde terug naar Constantinopel om anti-unionistische oppositie te organiseren. Hij werd twee jaar gevangengezet nadat hij tevergeefs probeerde zijn toevlucht te zoeken in het klooster op Mt. Athos. Vrijgelaten hervatte hij zijn antiwesterse campagne, waarbij hij deze verantwoordelijkheid op zijn sterfbed overdroeg aan Georgios Scholarios, de toekomstige patriarch Gennadius II.
Eugenikos 'geschriften zijn onder meer een geloofsbelijdenis (bekentenisoverzicht), interpretaties van de kerkvaders, een kritiek op de Latijnse leer over de Drieëenheid en een weerlegging van het gebruik van ongezuurd brood door de Westerse Kerk in de communiedienst. Hij bestreed met name de westerse leer over het vagevuur. Eugenikos schreef ook verhandelingen over liturgische onderwerpen, waarin hij de westerse ritus bekritiseerde, en schreef verschillende traktaten over ascetische thema's. Hij werd in 1734 door de Grieks-Orthodoxe Kerk officieel tot heilige uitgeroepen.
