Comayagua, stad, west-centraal Honduras, op de rechteroever van de Humuya-rivier in een vruchtbare vallei.
Opgericht in 1537 als Valladolid de Santa María de Comayagua, diende de stad als de Spaanse koloniale hoofdstad van de provincie Honduras. Een variant van zijn naam, Comayaguela, wordt gebruikt voor het regeringsdistrict Tegucigalpa. Het leed schade tijdens de 19e-eeuwse politieke omwentelingen van Honduras en in rivaliteit met Tegucigalpa voor de positie van nationaal kapitaal, maar pas in 1880 werd de hoofdstad definitief overgedragen aan Tegucigalpa. De stad leed ook schade door verschillende aardbevingen en herhaalde branden.
Koloniale gebouwen omvatten een opmerkelijke Spaanse barokke kathedraal (1715), vier 16e-eeuwse kerken en een voormalige universiteit - de eerste in Midden-Amerika, opgericht in 1632. Comayagua vervaardigt geneesmiddelen, schoenen, harsen, cementproducten en keramiek; het is het commerciële centrum van West-Honduras. Het nationale landbouwcentrum bevindt zich in de stad. Een groot deel van de binnenstad, inclusief de kathedraal en het centrale park, is gerenoveerd om de koloniale sfeer en unieke charme van de stad te herstellen.
De Inter-Oceanic Highway loopt door de stad. Comayagua heeft ook een vliegveld, dat begin jaren tachtig werd opgewaardeerd tot een militaire luchtmachtbasis. Net buiten Comayagua ligt Palmerola, de belangrijkste Amerikaanse militaire basis in Honduras, die wordt gedeeld met de Hondurese luchtmacht. Knal. (2001) 55.368; (2013) 92.883.
