Biogeochemie, de studie van het gedrag van anorganische chemische elementen in biologische systemen van geologische reikwijdte in tegenstelling tot organische geochemie, dat is de studie van de organische verbindingen die worden aangetroffen in geologische materialen en meteorieten, inclusief die van problematische biologische oorsprong. Onderwerpen die zijn geclassificeerd binnen biogeochemie en organische geochemie zijn onder meer de oorsprong van aardolie, de oorsprong van leven, de samenstelling van primitieve atmosferen, biogeochemische prospectie voor minerale afzettingen, de oorsprong van bepaalde ertsafzettingen, de chemie van natuurlijk water, bodemvorming en de chemie steenkool. Bijna alle geologische processen die plaatsvinden aan het aardoppervlak worden beïnvloed door biologische activiteit.
